Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtlP38585 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TtlP38585 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TtlP38585 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TtlP38585 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TtlP38585 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TtlP38585 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtlP38585 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtlP38585 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtlP38585 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtlP38585 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 919.7 ms