Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpargP37238 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpargP37238 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpargP37238 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpargP37238 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpargP37238 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpargP37238 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpargP37238 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PpargP37238 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpargP37238 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpargP37238 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PpargP37238 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpargP37238 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpargP37238 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpargP37238 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpargP37238 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpargP37238 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpargP37238 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PpargP37238 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpargP37238 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms