Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddit3P35639 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddit3P35639 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms