Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfc1P35601 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rfc1P35601 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms