Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab6aP35279 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab6aP35279 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms