Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab5cP35278 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5cP35278 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms