Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sftpa1P35242 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sftpa1P35242 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sftpa1P35242 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms