Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apoc1P34928 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms