Protein–RNA interactions for Protein: P31648

Slc6a1, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a1P31648 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a1P31648 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a1P31648 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms