Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx2P31316 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms