Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms