Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa11P31311 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa11P31311 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms