Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms