Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msr1P30204 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msr1P30204 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms