Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GrnP28798 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GrnP28798 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GrnP28798 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GrnP28798 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GrnP28798 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GrnP28798 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GrnP28798 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GrnP28798 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GrnP28798 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms