Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Hoxd10P28359 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Hoxd10P28359 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Hoxd10P28359 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Hoxd10P28359 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Hoxd10P28359 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd10P28359 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Hoxd10P28359 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Hoxd10P28359 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms