Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defa3P28310 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Defa3P28310 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defa3P28310 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms