Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja4P28235 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms