Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vav1P27870 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav1P27870 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav1P27870 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vav1P27870 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vav1P27870 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vav1P27870 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms