Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpbP27790 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms