Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd40lgP27548 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms