Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1bP25119 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1bP25119 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms