Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gria1P23818 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gria1P23818 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria1P23818 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gria1P23818 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms