Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkchP23298 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkchP23298 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkchP23298 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkchP23298 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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