Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd3eP22646 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd3eP22646 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd3eP22646 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd3eP22646 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd3eP22646 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms