Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk1P22518 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms