Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SftpcP21841 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpcP21841 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms