Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms