Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a2P20490 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms