Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TP20293 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TP20293 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TP20293 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TP20293 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TP20293 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TP20293 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TP20293 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TP20293 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TP20293 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TP20293 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TP20293 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TP20293 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TP20293 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TP20293 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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