Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms