Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PcnaP17918 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PcnaP17918 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PcnaP17918 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms