Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa-rs1P17533 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms