Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptbp1P17225 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptbp1P17225 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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