Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prph2P15499 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prph2P15499 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prph2P15499 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prph2P15499 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prph2P15499 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms