Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms