Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga5P11688 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga5P11688 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms