Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lamp1P11438 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms