Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FlgP11088 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FlgP11088 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FlgP11088 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FlgP11088 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FlgP11088 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FlgP11088 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FlgP11088 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FlgP11088 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FlgP11088 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FlgP11088 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FlgP11088 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FlgP11088 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FlgP11088 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FlgP11088 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FlgP11088 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms