Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spp1P10923 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms