Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P10404 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P10404 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P10404 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P10404 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P10404 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P10404 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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