Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms