Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufb1P0DN34 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms