Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf3P09920 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3P09920 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf3P09920 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms