Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa6P09092 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa6P09092 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa6P09092 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa6P09092 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa6P09092 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa6P09092 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa6P09092 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa6P09092 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa6P09092 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa6P09092 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms