Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxb5P09079 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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