Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NeflP08551 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NeflP08551 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NeflP08551 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NeflP08551 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NeflP08551 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NeflP08551 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NeflP08551 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NeflP08551 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NeflP08551 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NeflP08551 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NeflP08551 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NeflP08551 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NeflP08551 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NeflP08551 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NeflP08551 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NeflP08551 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NeflP08551 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NeflP08551 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NeflP08551 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NeflP08551 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NeflP08551 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NeflP08551 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NeflP08551 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NeflP08551 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NeflP08551 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NeflP08551 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms