Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spta1P08032 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spta1P08032 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms