Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa4P06728 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa4P06728 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms