Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06344 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06344 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06344 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06344 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06344 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06344 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06344 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06344 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06344 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P06344 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06344 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06344 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06344 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06344 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06344 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms